93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1278 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.286027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1691  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  74.89 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0913  alpha/beta superfamily-like hydrolase  74.03 
 
 		 234 aa  328  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2427  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  69.39 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3897  alpha/beta hydrolase  70.82 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3998  hypothetical protein  71.67 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.029016  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1245  hypothetical protein  69.23 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3616  hypothetical protein  70.82 
 
 		 266 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2397  hypothetical protein  68.67 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0354  hypothetical protein  69.53 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1606  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  65.95 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2330  hypothetical protein  64.85 
 
 		 266 aa  286  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000212255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2597  hypothetical protein  64.44 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  30.66 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  30.66 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.19 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  30.37 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  32.39 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  28.72 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  30.48 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  35.65 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  31.91 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  30.1 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  29.38 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  35 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  29.63 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  29.63 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  34.45 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  34.17 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  30.51 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  28.19 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  33.72 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  34.92 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  34.92 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  32.83 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  31.93 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  35.48 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  32.83 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  34.92 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  34.92 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4813  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.34 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  34.68 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  34.68 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  34.68 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  31.93 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  31.93 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  31.09 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  36.97 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  36.97 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.33 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  35.45 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  31.93 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  31.93 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  31.93 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  33.64 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  33.14 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  32.54 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.5 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  33.04 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.12 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  38.32 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  39.6 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  33.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  34.29 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.62 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  38.95 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  30.22 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  30.51 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.06 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.05 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  31.15 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  36.84 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  37.89 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  35.85 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.1 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  29.35 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  31.25 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  31.1 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.1 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.1 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  30.9 
 
 		 200 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>