110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3616 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3998  hypothetical protein  95.47 
 
 		 270 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.029016  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1606  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  76.25 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0913  alpha/beta superfamily-like hydrolase  73.59 
 
 		 234 aa  332  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1691  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  72.88 
 
 		 237 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1245  hypothetical protein  68.85 
 
 		 246 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1278  hypothetical protein  70.82 
 
 		 242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.286027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2397  hypothetical protein  67.23 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2427  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  65.57 
 
 		 261 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0354  hypothetical protein  65.55 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3897  alpha/beta hydrolase  66.09 
 
 		 238 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2597  hypothetical protein  60.98 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2330  hypothetical protein  59.76 
 
 		 266 aa  271  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000212255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  29.9 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  29.9 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  30.26 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  33.87 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  29.06 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.83 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  29.35 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  28.96 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  27.59 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  34.85 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  36.36 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  34.85 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.09 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  30.93 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  32.14 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  28.36 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  33.58 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  33.61 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  33.61 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.1 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  33.61 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  37.38 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  30.36 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  29.89 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  33.61 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4813  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.51 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  34.82 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  34.82 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  34.82 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  26.94 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  34.45 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  37.63 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  37.07 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  31.86 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  36.46 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  27.27 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  27.27 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  28.89 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  33.05 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  26.96 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  24.24 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.94 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  32.04 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  29.94 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  29.94 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  25.98 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  25.98 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  26.96 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.09 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  31.43 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  25.13 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.15 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  32.29 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.94 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.94 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  30.94 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  36.46 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.56 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  35.14 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.74 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  30 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.56 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.56 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  31.49 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  33.61 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  35.92 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.29 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  29.63 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>