246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2259 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2259  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0460618 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.52 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 		 187 aa  227  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 183 aa  227  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 181 aa  223  8e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 		 182 aa  221  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  56.9 
 
 		 180 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.65 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.65 
 
 		 178 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 174 aa  214  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 184 aa  213  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 184 aa  213  9e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 		 176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.65 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.19 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.59 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.59 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 184 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.63 
 
 		 189 aa  208  4e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 178 aa  207  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.59 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 186 aa  207  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 196 aa  207  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 189 aa  207  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 		 172 aa  207  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 176 aa  207  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 		 174 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 206 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 		 174 aa  207  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.31 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.05 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.48 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.72 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.73 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.06 
 
 		 183 aa  204  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.23 
 
 		 174 aa  203  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 		 175 aa  203  9e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 180 aa  203  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 180 aa  202  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 180 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 180 aa  202  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 180 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 180 aa  202  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.89 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>