67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1882 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1882  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  24.27 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  24.27 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  24.27 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  23.85 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  24.27 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  25 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  25.41 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4186  bioH protein, putative  25.1 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  22.99 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  24.18 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  23.69 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  22.18 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  23.14 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  22.73 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  24.5 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  24.89 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  24.29 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  25.48 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  24.29 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  25.48 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  24.29 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  24.29 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  25.48 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  22.73 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  21.43 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  22.55 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  24.8 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  25.57 
 
 
259 aa  48.9  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  23.44 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  24.51 
 
 
240 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  23.77 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  23.35 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  23.72 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  21.72 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  24.9 
 
 
558 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  25.3 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0961  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0214674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  26.03 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  21.86 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  22.5 
 
 
240 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  25.28 
 
 
240 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  22.31 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  22.97 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  21.31 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  25.1 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  23.02 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  21.91 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  23.46 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  23.6 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  21.91 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  21.91 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  21.91 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  21.91 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  21.91 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  25.1 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  21.51 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  24.82 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  21.91 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  21.12 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  28.64 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  24.82 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  25.13 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>