182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3810 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3810  methyltransferase type 11  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
256 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
282 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25.6 
 
 
253 aa  49.7  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
267 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
200 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  23.94 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.09 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
710 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  25.35 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 
194 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.26 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  26.11 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
194 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  31.68 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.74 
 
 
561 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.25 
 
 
310 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.74 
 
 
561 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  33.66 
 
 
222 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  26 
 
 
248 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
250 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.32 
 
 
258 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
401 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
248 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
711 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
287 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  31.68 
 
 
226 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  26.49 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
2490 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3382  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  26.04 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  22.92 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  23.26 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.51 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  36.46 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  22.93 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.82 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  28 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  22.44 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  28 
 
 
211 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  28 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  25.77 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  25.79 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  27.61 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.7 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  26.34 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.37 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  24.71 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  30.85 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  25.98 
 
 
398 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>