More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3534 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3534  aldo/keto reductase  100 
 
 
330 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1041  aldo/keto reductase  64.31 
 
 
329 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1108  aldo/keto reductase  62.15 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  33.76 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.2 
 
 
331 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
331 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.54 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.27 
 
 
332 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.49 
 
 
344 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.67 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  36.19 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  37.28 
 
 
349 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  34.95 
 
 
315 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
309 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  35.12 
 
 
315 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.28 
 
 
343 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00675  aflatoxin B1-aldehyde reductase GliO-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13370)  32.54 
 
 
349 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.368702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  35.96 
 
 
313 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  36.55 
 
 
313 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  35.45 
 
 
344 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  33.73 
 
 
344 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  35.96 
 
 
313 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.17 
 
 
335 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
327 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  33.73 
 
 
389 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  33.92 
 
 
344 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  36.55 
 
 
343 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  33.54 
 
 
327 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  34.33 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  35.5 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  32.48 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  35.83 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  34.78 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
335 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  34.21 
 
 
344 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  34.58 
 
 
327 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  33.44 
 
 
336 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  36.21 
 
 
313 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  36.55 
 
 
343 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  33 
 
 
340 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  35.55 
 
 
352 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  35.97 
 
 
345 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  36.22 
 
 
343 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
324 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  37.75 
 
 
311 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  35.83 
 
 
344 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00377  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
346 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.188637  normal  0.0562743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  35.16 
 
 
339 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  34.78 
 
 
333 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
337 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  33.77 
 
 
334 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
351 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  30.45 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
342 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  35.45 
 
 
346 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0491  aldo/keto reductase  37.14 
 
 
334 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00588566  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.24 
 
 
327 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  34.56 
 
 
349 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  34.56 
 
 
349 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  32.88 
 
 
334 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  34.07 
 
 
342 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  34.68 
 
 
323 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  34.56 
 
 
352 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
322 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  33.01 
 
 
319 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  32.32 
 
 
345 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
358 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
325 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  31.47 
 
 
336 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  37.06 
 
 
316 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  35.29 
 
 
324 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
316 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
336 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51237  predicted protein  34.43 
 
 
360 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  34.11 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  32.11 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  32.69 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  33.79 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  35.25 
 
 
339 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  35.25 
 
 
339 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  32.98 
 
 
321 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  35.15 
 
 
345 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  34.11 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  33.89 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  32.99 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  32.97 
 
 
341 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  35.29 
 
 
368 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  33.11 
 
 
344 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  35.11 
 
 
338 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  36.08 
 
 
325 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0539  oxidoreductase  36.1 
 
 
312 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  39.03 
 
 
323 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  32.67 
 
 
345 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>