More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0539 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0539  oxidoreductase  100 
 
 		 312 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0491  aldo/keto reductase  60.59 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00588566  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  46.37 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.33 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  41.47 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  41.33 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  41.33 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.47 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.33 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  41.47 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.47 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  38.59 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  40.26 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  41.01 
 
 		 336 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.91 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.55 
 
 		 343 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  38.66 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.72 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.72 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  36.91 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.83 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  40.72 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  39.6 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0523  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.39 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0468  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.39 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  38.54 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  36.08 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.17 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  37.85 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.06 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  36.28 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  38.76 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.92 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  35.53 
 
 		 351 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  37.85 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  38.31 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  36.56 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  39.03 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  40.53 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  36.71 
 
 		 353 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  39.74 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  36.73 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  38.24 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  39.35 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  38.01 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  36.94 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  36.98 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  38.28 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  37.7 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  38.01 
 
 		 349 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  37.85 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3365  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  36.5 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  38.29 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.46 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  40.26 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  38.41 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  37.96 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  37.85 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  36.22 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  38.59 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  37.62 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  39.55 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2388  aldo/keto reductase  37.06 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  38.76 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.06 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0071932  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  36.71 
 
 		 343 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 337 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  34.58 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  38.12 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  34.17 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  37.04 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  35.71 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  37.19 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  38.79 
 
 		 345 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>