139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0813 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  82.66 
 
 		 433 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  100 
 
 		 446 aa  879    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  70.59 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  63.21 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  62.84 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  54.93 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  46.78 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  44.06 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  42.79 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  40.8 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  44.67 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  42.27 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  43.44 
 
 		 496 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  41.08 
 
 		 438 aa  322  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  42.93 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  45.37 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  43.6 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  46.05 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  44.95 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  42.72 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  42.99 
 
 		 472 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  45 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  44.05 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  44.23 
 
 		 467 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  43.77 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  40.69 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  41.03 
 
 		 560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  41.08 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  42.57 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  42.89 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  40.81 
 
 		 503 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  42.09 
 
 		 473 aa  285  9e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  40.87 
 
 		 464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  39.23 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  40.81 
 
 		 458 aa  283  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  41.4 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  40.47 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  42.19 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  40.42 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  40.33 
 
 		 490 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  42.36 
 
 		 488 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  42.72 
 
 		 425 aa  278  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  40.51 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  39.76 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  44.34 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  41.69 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  41.57 
 
 		 524 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  40.48 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  40.48 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  39.83 
 
 		 528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  40.52 
 
 		 516 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  43.83 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  39.95 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  39.04 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  39.66 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  45.78 
 
 		 443 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  44.17 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  39.83 
 
 		 525 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  42.33 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  42.57 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  42.4 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  43.69 
 
 		 448 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  40.42 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  40.92 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  39.76 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  37.1 
 
 		 436 aa  255  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  39.23 
 
 		 453 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  39.75 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  38.98 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  41.61 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  37.25 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  40.68 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  39.72 
 
 		 467 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  37.85 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  38.02 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  37.73 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  38.89 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  40.55 
 
 		 488 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  38.22 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  44.29 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  39.48 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  36.77 
 
 		 498 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  33.11 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  39.95 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  40.69 
 
 		 522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  40.88 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  32.08 
 
 		 437 aa  196  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  33.98 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  30.93 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  30.79 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  30.54 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  29.23 
 
 		 464 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  30.11 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  31.57 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  31.24 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  29.25 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  30.65 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  28.85 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>