119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0946 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  928    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  54.88 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  57.58 
 
 
447 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  54.13 
 
 
446 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  51.97 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  53.45 
 
 
481 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  54.23 
 
 
472 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  49.79 
 
 
496 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  51.69 
 
 
472 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  47.23 
 
 
546 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  49.57 
 
 
462 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  48.11 
 
 
522 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  52.64 
 
 
491 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  56.77 
 
 
448 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  56.77 
 
 
448 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  53.63 
 
 
449 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  52.15 
 
 
464 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  50 
 
 
459 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  52.27 
 
 
455 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  46.57 
 
 
510 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  49.55 
 
 
489 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  51.02 
 
 
473 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  48.75 
 
 
490 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  52.86 
 
 
458 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  47.77 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  51.15 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  51.72 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  52.38 
 
 
458 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  47.19 
 
 
560 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  52.1 
 
 
453 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  47.19 
 
 
503 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  47.29 
 
 
501 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  52.27 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  49.66 
 
 
524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  49.33 
 
 
519 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  51.28 
 
 
443 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  49.33 
 
 
519 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  49.34 
 
 
525 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  50.32 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  50.56 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  48.76 
 
 
516 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  47.31 
 
 
508 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  51.07 
 
 
467 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  48.56 
 
 
525 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  49 
 
 
528 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  46.68 
 
 
464 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  48.06 
 
 
488 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  48.96 
 
 
470 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  48.94 
 
 
501 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  47.53 
 
 
454 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  52.06 
 
 
443 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  48.84 
 
 
488 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  48.81 
 
 
501 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  48.57 
 
 
501 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  47.17 
 
 
529 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  45.58 
 
 
498 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  47.71 
 
 
465 aa  353  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  47.57 
 
 
486 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  43.64 
 
 
467 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  49.04 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  43.41 
 
 
500 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  42.59 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  38.52 
 
 
429 aa  307  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  39.86 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  36.68 
 
 
444 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  40.53 
 
 
430 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  37.15 
 
 
438 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  40.09 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  37.7 
 
 
470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  37.25 
 
 
451 aa  269  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  36.22 
 
 
443 aa  269  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  39.14 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  42.72 
 
 
446 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  37.79 
 
 
445 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  37.24 
 
 
434 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  36.73 
 
 
453 aa  253  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  36.73 
 
 
447 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  35.65 
 
 
436 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  36.93 
 
 
443 aa  239  9e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  36.79 
 
 
471 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  36.47 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  36.36 
 
 
425 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  36.75 
 
 
472 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  37.25 
 
 
462 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  37.11 
 
 
452 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  33.8 
 
 
452 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  31.54 
 
 
455 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  31.19 
 
 
437 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  32.79 
 
 
421 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  34.51 
 
 
442 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  30.41 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  29.89 
 
 
464 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  29.15 
 
 
427 aa  156  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  28.25 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  28.95 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  29.7 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  27.27 
 
 
436 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  30.7 
 
 
424 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  27.46 
 
 
424 aa  93.2  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  29.08 
 
 
447 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>