117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2176 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  100 
 
 
560 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  89.27 
 
 
557 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  98.17 
 
 
503 aa  866    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  99.8 
 
 
501 aa  947    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  75.92 
 
 
524 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  75.7 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  74.51 
 
 
525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  74.95 
 
 
519 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  74.95 
 
 
519 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  72.67 
 
 
525 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  72.22 
 
 
528 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  60.19 
 
 
546 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  67.09 
 
 
508 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  60.84 
 
 
522 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  58.06 
 
 
472 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  60.63 
 
 
491 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  56.6 
 
 
456 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  56.86 
 
 
446 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  58.12 
 
 
462 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  58.26 
 
 
470 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  58.12 
 
 
464 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  54.39 
 
 
453 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  54.76 
 
 
481 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  55.65 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  53.91 
 
 
447 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  49.36 
 
 
459 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  56 
 
 
443 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  53.7 
 
 
449 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  47.19 
 
 
463 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  53.69 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  53.24 
 
 
448 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  56.67 
 
 
443 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  51.75 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  54.1 
 
 
453 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  50.33 
 
 
488 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  48.25 
 
 
460 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  51.13 
 
 
467 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  47.62 
 
 
458 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  42.52 
 
 
496 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  46.04 
 
 
458 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  46.92 
 
 
473 aa  364  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  47.7 
 
 
488 aa  364  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  41.38 
 
 
510 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  44.72 
 
 
490 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  47.92 
 
 
452 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  43.3 
 
 
455 aa  355  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  44.06 
 
 
489 aa  346  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  43.01 
 
 
458 aa  345  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  41.98 
 
 
455 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  47.45 
 
 
529 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  45.07 
 
 
464 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  43.37 
 
 
501 aa  329  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  47.23 
 
 
467 aa  329  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  40.5 
 
 
501 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  42 
 
 
501 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  46.53 
 
 
486 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  39.24 
 
 
454 aa  320  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  46.78 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  41.37 
 
 
498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  41.85 
 
 
500 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  41.91 
 
 
468 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  41.26 
 
 
433 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  41.42 
 
 
437 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  37.47 
 
 
444 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  35.48 
 
 
438 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  39.52 
 
 
470 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  41.26 
 
 
439 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  33.49 
 
 
429 aa  264  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  41.03 
 
 
430 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  36.21 
 
 
443 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  41.16 
 
 
446 aa  246  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  36.36 
 
 
434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  37.01 
 
 
423 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  34.91 
 
 
451 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  37.22 
 
 
447 aa  233  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  35.7 
 
 
436 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  35.97 
 
 
445 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  39.63 
 
 
443 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  37.17 
 
 
425 aa  225  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  37.14 
 
 
471 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  34.67 
 
 
453 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  36.91 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  37.14 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  36.64 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  34.01 
 
 
452 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  27.37 
 
 
437 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  30.17 
 
 
464 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  30 
 
 
442 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  29.11 
 
 
462 aa  167  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  30.11 
 
 
464 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  28.83 
 
 
455 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  30.44 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  27.37 
 
 
427 aa  124  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  27.27 
 
 
428 aa  113  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  27.58 
 
 
438 aa  101  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  26.85 
 
 
436 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0167  hypothetical protein  39.62 
 
 
175 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  26.12 
 
 
458 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 
424 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  26.81 
 
 
447 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>