111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1013 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
455 aa  895    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  45.54 
 
 
464 aa  350  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  44.63 
 
 
464 aa  342  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  32.85 
 
 
436 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  31.54 
 
 
463 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  34.27 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  30.44 
 
 
459 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  28.51 
 
 
456 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  32.94 
 
 
425 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  34.59 
 
 
437 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  31.57 
 
 
472 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  30.09 
 
 
464 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  30.87 
 
 
448 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  30.53 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  30.65 
 
 
448 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  29.8 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  29.55 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  28.74 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  30.21 
 
 
481 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  29.01 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  34.33 
 
 
423 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  29.87 
 
 
438 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  30.38 
 
 
508 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  30.14 
 
 
444 aa  160  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  29.87 
 
 
449 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  30.2 
 
 
451 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  28.03 
 
 
491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  29.93 
 
 
524 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  30.5 
 
 
453 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  27.19 
 
 
458 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  28.83 
 
 
546 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  30.05 
 
 
464 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  28.08 
 
 
455 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  30.46 
 
 
467 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  31.4 
 
 
434 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  31.29 
 
 
433 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  28.97 
 
 
488 aa  150  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  26.95 
 
 
429 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  28.95 
 
 
557 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  29.04 
 
 
525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  29.01 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  30.18 
 
 
460 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  28.96 
 
 
516 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  27.09 
 
 
458 aa  147  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  28.37 
 
 
465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  28.57 
 
 
528 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  26.74 
 
 
455 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  27.55 
 
 
458 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  28.31 
 
 
519 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  28.31 
 
 
519 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  30.53 
 
 
443 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  27.88 
 
 
560 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  26.05 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  28.54 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  31.02 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  31.72 
 
 
430 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  27.69 
 
 
525 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  27.89 
 
 
501 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  25.41 
 
 
489 aa  140  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  30.77 
 
 
443 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  28.5 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  30.05 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  31.99 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  30.23 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  29.34 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  25.75 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  28.74 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  28.41 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  29.34 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  29.02 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  28.28 
 
 
488 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  28.85 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  25.91 
 
 
468 aa  126  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  24.79 
 
 
496 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  26.81 
 
 
470 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  24.71 
 
 
498 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  29.78 
 
 
472 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  24.68 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  25.99 
 
 
488 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  29.94 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  28.5 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  25 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  25 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  29.02 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  25.93 
 
 
500 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  23.62 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  29.17 
 
 
510 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  30.51 
 
 
452 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  24.05 
 
 
437 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  25.38 
 
 
490 aa  100  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  26.48 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  26.99 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  26.14 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  23.54 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  23.76 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1395  hypothetical protein  28.92 
 
 
364 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51965  normal  0.883409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  24.91 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  30.34 
 
 
154 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  41.94 
 
 
96 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>