30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_751 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0847  hypothetical protein  95.83 
 
 		 96 aa  157  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0766  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  92.71 
 
 		 96 aa  156  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.328817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  46.15 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  45.45 
 
 		 443 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  36.96 
 
 		 455 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  34.07 
 
 		 433 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  40.62 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  31.87 
 
 		 430 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  40.32 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  38.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  28.57 
 
 		 423 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  32.61 
 
 		 429 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  32.22 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  31.87 
 
 		 439 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 437 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  34.09 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  33.72 
 
 		 464 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  37.31 
 
 		 464 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  37.31 
 
 		 464 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  31.31 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.81 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  29.76 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  32.97 
 
 		 446 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 423 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  33.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  33.77 
 
 		 438 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  29.27 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4951  protein of unknown function DUF107  35.29 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125072  normal  0.546371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>