118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3654 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  73.25 
 
 
560 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  85.94 
 
 
525 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  76.92 
 
 
557 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  85.96 
 
 
519 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  84.13 
 
 
525 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  85.96 
 
 
519 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  73.25 
 
 
503 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  76.1 
 
 
501 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1004    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  86.52 
 
 
516 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  82.89 
 
 
528 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  62.7 
 
 
546 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  63.14 
 
 
522 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  65.83 
 
 
508 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  58 
 
 
472 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  58.09 
 
 
462 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  57.62 
 
 
456 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  58.31 
 
 
464 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  59.37 
 
 
491 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  58.72 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  56.32 
 
 
446 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  57.81 
 
 
472 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  53.46 
 
 
453 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  51.95 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  54.46 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  49.66 
 
 
463 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  57.59 
 
 
443 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  53.88 
 
 
449 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  54.02 
 
 
448 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  51.02 
 
 
459 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  53.79 
 
 
448 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  53.42 
 
 
488 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  56.04 
 
 
453 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  45.38 
 
 
496 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  57.81 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  49.89 
 
 
460 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  48.96 
 
 
488 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  50.45 
 
 
458 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  50 
 
 
458 aa  389  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  47.77 
 
 
473 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  50.11 
 
 
467 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  45.99 
 
 
489 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  50.86 
 
 
452 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  46.83 
 
 
488 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  44.97 
 
 
455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  44.54 
 
 
458 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  43.37 
 
 
490 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  44.2 
 
 
455 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  44.17 
 
 
464 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  47.74 
 
 
467 aa  347  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  47.83 
 
 
465 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  47.14 
 
 
529 aa  342  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  44.9 
 
 
486 aa  329  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  43.72 
 
 
501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  38.6 
 
 
454 aa  321  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  42 
 
 
501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  42.57 
 
 
501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  41.18 
 
 
498 aa  312  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  42.49 
 
 
500 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  41.43 
 
 
468 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  42.67 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  36.82 
 
 
438 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  37.31 
 
 
444 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  40.67 
 
 
433 aa  269  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  40.47 
 
 
470 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  41.19 
 
 
446 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  38.57 
 
 
439 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  32.58 
 
 
429 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  38.43 
 
 
430 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  35.96 
 
 
443 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  38.5 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  36.81 
 
 
423 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  36.78 
 
 
445 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  36.2 
 
 
434 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  35.16 
 
 
436 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  35.98 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  39.59 
 
 
443 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  33.74 
 
 
451 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  35.9 
 
 
425 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  35.98 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  38.21 
 
 
452 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  35.32 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  36.83 
 
 
472 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  33.95 
 
 
452 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  28.76 
 
 
437 aa  171  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  30.92 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  30.28 
 
 
455 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  26.65 
 
 
462 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  27.99 
 
 
442 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  31.4 
 
 
421 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  30.19 
 
 
464 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  51.03 
 
 
510 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  28.17 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  27.41 
 
 
427 aa  120  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  28.67 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  29.73 
 
 
436 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  28.42 
 
 
458 aa  94  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  32.23 
 
 
424 aa  90.1  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  28.23 
 
 
447 aa  88.2  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0167  hypothetical protein  41.25 
 
 
175 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>