84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0167 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  56.46 
 
 		 472 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  51.02 
 
 		 481 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  54.9 
 
 		 448 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  55.33 
 
 		 448 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  53.02 
 
 		 447 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  47.71 
 
 		 449 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  52.78 
 
 		 443 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  51.39 
 
 		 443 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  40.51 
 
 		 522 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  38.24 
 
 		 508 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  38.55 
 
 		 546 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  44.59 
 
 		 456 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  40.56 
 
 		 488 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  39.86 
 
 		 462 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  39.51 
 
 		 560 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  39.51 
 
 		 501 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  39.51 
 
 		 503 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  39.16 
 
 		 464 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  38.55 
 
 		 557 aa  94.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  40.97 
 
 		 446 aa  92  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  42.18 
 
 		 472 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  40.43 
 
 		 491 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  39.04 
 
 		 463 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  36.36 
 
 		 470 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  41.38 
 
 		 519 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  41.38 
 
 		 519 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  35.53 
 
 		 490 aa  84.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  40.56 
 
 		 525 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  38.41 
 
 		 496 aa  84  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  41.01 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  40.82 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  40.14 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  40.14 
 
 		 525 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  38.78 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  35.25 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  35.86 
 
 		 488 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  39.87 
 
 		 455 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  35.17 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  29.49 
 
 		 473 aa  75.5  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  31.43 
 
 		 460 aa  75.1  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  36.36 
 
 		 459 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  31.16 
 
 		 454 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  35.38 
 
 		 488 aa  74.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  33.09 
 
 		 455 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  35.43 
 
 		 458 aa  70.9  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  34.33 
 
 		 458 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  32.43 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  42.66 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  33.57 
 
 		 467 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  35.07 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  33.08 
 
 		 437 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  33.33 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  36.84 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  34.46 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  32.54 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  34.92 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  31.58 
 
 		 501 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  31.43 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  32.56 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  31.58 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  32.06 
 
 		 486 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  23.33 
 
 		 437 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  29.32 
 
 		 470 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  31.29 
 
 		 498 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  30.66 
 
 		 438 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  28.48 
 
 		 462 aa  50.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  27.69 
 
 		 423 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 425 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  31.54 
 
 		 467 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  30.66 
 
 		 453 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  24.7 
 
 		 429 aa  47.8  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  31.03 
 
 		 444 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  24.43 
 
 		 442 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  33.1 
 
 		 465 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  31.71 
 
 		 447 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  30.89 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  29.27 
 
 		 433 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  26.32 
 
 		 443 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  29.17 
 
 		 451 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  26.03 
 
 		 137 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  27.21 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>