112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  100 
 
 
443 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  93.45 
 
 
443 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  65.44 
 
 
472 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  63.62 
 
 
481 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  61.48 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  65.96 
 
 
448 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  63.59 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  63.74 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  65.72 
 
 
448 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  60.28 
 
 
446 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  52.87 
 
 
522 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  52.1 
 
 
546 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  56.03 
 
 
456 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  58.55 
 
 
491 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  57.55 
 
 
464 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  57.83 
 
 
462 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  57.83 
 
 
470 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  56.05 
 
 
557 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  57.88 
 
 
524 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  55.98 
 
 
560 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  55.98 
 
 
503 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  55.46 
 
 
508 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  56.04 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  51.28 
 
 
463 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  54.69 
 
 
525 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  52.24 
 
 
453 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  56.28 
 
 
519 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  54.89 
 
 
525 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  56.28 
 
 
519 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  56.21 
 
 
516 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  55.03 
 
 
528 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  52.73 
 
 
459 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  48.93 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  54.87 
 
 
467 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  52.97 
 
 
452 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  53.27 
 
 
488 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  56.46 
 
 
453 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  51.93 
 
 
458 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  50.94 
 
 
460 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  49 
 
 
458 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  49.44 
 
 
489 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  48.75 
 
 
455 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  51.21 
 
 
458 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  50.11 
 
 
488 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  48.28 
 
 
473 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  45.06 
 
 
510 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  51.45 
 
 
464 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  47.2 
 
 
490 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  47.09 
 
 
455 aa  358  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  49.3 
 
 
488 aa  352  7e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  50.59 
 
 
529 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  46.76 
 
 
501 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  45.48 
 
 
454 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  46.09 
 
 
498 aa  338  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  43.91 
 
 
501 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  48.57 
 
 
486 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  45.7 
 
 
501 aa  325  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  45.96 
 
 
500 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  46.62 
 
 
467 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  46.79 
 
 
465 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  46.93 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  44.16 
 
 
468 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  43 
 
 
444 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  43.91 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  41.86 
 
 
470 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  39 
 
 
451 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  42.89 
 
 
433 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  41.03 
 
 
423 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  35.41 
 
 
429 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  39.56 
 
 
438 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  43.28 
 
 
430 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  43.87 
 
 
446 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  40.62 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  38.97 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  39.49 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  41.08 
 
 
447 aa  244  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  40.63 
 
 
436 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  39.05 
 
 
472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  39.95 
 
 
471 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  40.19 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  38.39 
 
 
425 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  40.21 
 
 
445 aa  223  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  41.28 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  36.54 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  33.07 
 
 
462 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  39.12 
 
 
452 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  29.86 
 
 
437 aa  186  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  35.41 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  32.3 
 
 
442 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  30.53 
 
 
455 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  30.79 
 
 
464 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  30.44 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  28.96 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0167  hypothetical protein  52.78 
 
 
175 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  32.59 
 
 
438 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  28.67 
 
 
428 aa  120  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  29.38 
 
 
454 aa  117  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
424 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  29.41 
 
 
436 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  30.73 
 
 
458 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>