113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3678 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 131 aa  253  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  63.49 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  59.2 
 
 		 195 aa  157  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  57.36 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  57.02 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  54.33 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  54.33 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  49.09 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  49.54 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  46.56 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  40.77 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  41.73 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  40.46 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  42.06 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  38.58 
 
 		 142 aa  84.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  42.98 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  41.32 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  36.44 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  39.52 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  40.35 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  41.8 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  41.3 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  41.03 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  41.51 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  40.68 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  41.41 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  35.82 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  36.61 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  35.24 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  46.91 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  36.29 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  31.4 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  31.75 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  42.17 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  34.51 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  39.02 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  39.02 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  34.4 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  30.08 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  47.73 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  34.88 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  33.63 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  40.79 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  35.59 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  29.13 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  35.09 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  42.11 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  30.89 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  38.75 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  36.14 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  27.78 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  28.95 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  40.23 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  32.99 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  29.36 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  39.77 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  34.17 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  29.46 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  35.59 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  30.39 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2961  hypothetical protein  37.11 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  31.71 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  32.41 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  32.11 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  32.95 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  29.46 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  32.67 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  32.52 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  22.83 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  35.9 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0548  hypothetical protein  30.58 
 
 		 136 aa  43.9  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  27.88 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  35.48 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>