150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2723 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 133 aa  248  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  74.63 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  57.69 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  60.77 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  58.02 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  61.68 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  47.66 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  41.07 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  44.34 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  43.24 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  45.79 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  44.86 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  44.14 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  43.93 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  35.38 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  63.64 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  45 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  41.12 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  47.25 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  43.64 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  38.52 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  39.32 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  42.45 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  41.51 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  48.89 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  41.94 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  38.28 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  43 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  46.91 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  39.05 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  46.09 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  39.62 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  46.09 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  33.05 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  35.43 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  48.15 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  41.58 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  37.21 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  36.8 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  36.22 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  34.62 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  46.81 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  44.34 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  36.56 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  36.27 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  34.48 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  39.56 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  37.25 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  37.76 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  36.26 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  37.69 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  36.96 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  34.13 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  40.17 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  43.97 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  40.74 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  36 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  34.68 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  34.78 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  41.46 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  41 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  45.65 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  43.04 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  40.57 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  36.79 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>