150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0171 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  79.82 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  77.88 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  56.52 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  54.78 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  52.17 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  52.17 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  52.17 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  52.17 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  52.17 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  52.17 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  53.91 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  53.91 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  52.17 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  81.73 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  81.73 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  55.36 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  60.87 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  53.64 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  48.15 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  49.12 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  46.85 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  53.92 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  56.14 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  55.36 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  55.65 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  48.15 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  46.23 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  54.87 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  54.87 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  54.87 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  47.75 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  43.69 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  44.74 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  55.91 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  48.62 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  41.28 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  45.36 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  56.14 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  40.74 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  43.93 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  40.65 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  43.4 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  42.27 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  63.75 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  47.73 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  44.35 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  44.86 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  41.51 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  48.39 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  44.68 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  42.61 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  45.61 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  45.61 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  48.81 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  38.79 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  46.99 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  40.78 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  45.68 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  54.84 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  45.61 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  34.34 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  36.52 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  35.77 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  37.14 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0059  putative transmembrane protein  59.65 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  41.94 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  49.06 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  36.67 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  48.33 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  38.84 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  35.45 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  43.53 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>