152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2917 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  100 
 
 
146 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  94.02 
 
 
117 aa  207  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  92.31 
 
 
117 aa  204  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  88.03 
 
 
117 aa  200  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  86.32 
 
 
117 aa  196  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  86.32 
 
 
117 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  86.32 
 
 
117 aa  196  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  86.32 
 
 
117 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  86.32 
 
 
117 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  86.32 
 
 
117 aa  196  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  86.32 
 
 
117 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  58.26 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  50.43 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  50 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  53.91 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  50 
 
 
113 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  53.91 
 
 
115 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  53.21 
 
 
112 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  51.43 
 
 
114 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  56.73 
 
 
113 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  48.21 
 
 
117 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  46.85 
 
 
113 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  46.85 
 
 
113 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  55.36 
 
 
134 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  47.01 
 
 
117 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  50.45 
 
 
111 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  50 
 
 
117 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  50.46 
 
 
117 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  62.61 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  53.04 
 
 
115 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  54.13 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  53.27 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  50.47 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  52.08 
 
 
113 aa  95.9  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  50.94 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  48.15 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  42.11 
 
 
113 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  52.21 
 
 
144 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  54 
 
 
139 aa  93.6  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  49.02 
 
 
117 aa  93.6  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  52.21 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  45.45 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  47.66 
 
 
133 aa  91.3  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  53.27 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  53.26 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  53.27 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  52.63 
 
 
138 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  58.65 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  48.62 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  58.65 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  50.93 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  45.22 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  42.99 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  51.79 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  49.41 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  43.69 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  43.09 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  43.96 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  42.34 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  43.3 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  48.65 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  43.52 
 
 
145 aa  76.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  38.71 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  46.99 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  43.52 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  35.65 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  44.74 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  42.72 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  42.98 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  40.37 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  47.25 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  51.14 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  41.82 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  36.08 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  49.5 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  36.96 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  44.76 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  37.19 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  34.75 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  51.85 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 
129 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 
129 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  50.47 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  32 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  37.1 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  37.82 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>