143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4032 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  100 
 
 
144 aa  275  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  100 
 
 
122 aa  229  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  90.76 
 
 
124 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  81.2 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  77.78 
 
 
117 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  70.43 
 
 
115 aa  149  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  71.77 
 
 
139 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  65.25 
 
 
117 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  55.75 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  53.98 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  52.21 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  52.21 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  50.44 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  51.33 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  50.44 
 
 
117 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
117 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
117 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
117 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
117 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
117 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  63.27 
 
 
117 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  62.5 
 
 
122 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  50.49 
 
 
116 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  50.93 
 
 
117 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  46.73 
 
 
131 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  57.28 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  50.88 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  47.71 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  45.45 
 
 
113 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  45.45 
 
 
113 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  51.52 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  43.12 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  54.87 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  47.01 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  39.29 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  43.75 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  47.57 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  38.39 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  45.79 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0059  putative transmembrane protein  69.23 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0902612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  49.54 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  53.4 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  43.12 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  36.29 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  53.57 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  43.64 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  43.12 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  44.64 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  44.64 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  43.27 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  43.59 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  47.22 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  38.98 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  43.36 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  40 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  57.28 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  57.28 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  36.61 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  45.26 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  35.85 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  35.34 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  41.12 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  39.18 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  42.59 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  42.22 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  36.67 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  50 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.26 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  45.79 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  35.19 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  32.54 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  41.28 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  49.07 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3707  membrane protein of unknown function  35.34 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  36.13 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  35.78 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  34.23 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  50.44 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  35.35 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  37.17 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>