144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5175 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 117 aa  209  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  76.11 
 
 		 115 aa  157  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  72.65 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  77.59 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  77.78 
 
 		 144 aa  146  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  77.78 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  72.65 
 
 		 124 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  72.41 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  70.1 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  52.14 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  54.46 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  53.57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  53.57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  53.57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  53.57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  53.57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  53.57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  52.14 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  51.28 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  50.43 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  57 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  62.93 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  44.07 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  57.84 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  50.93 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  51.33 
 
 		 113 aa  95.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  59.8 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  48 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  54.63 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  43.4 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  55.36 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  44.35 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  45.19 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  46.79 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  43.27 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  41.07 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  45.54 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0059  putative transmembrane protein  65.52 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  40.95 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  42.74 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  42.45 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  44 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  41.12 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  59.8 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  59.8 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  39.81 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  47.19 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  38.79 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  47.06 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  45.22 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  37.38 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  45.22 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  47.87 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  44 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  39.42 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  37.38 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  57.29 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  45.16 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  50.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  40.19 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  38.68 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  45 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  37.7 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  40.19 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  39.32 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  37.07 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  42 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0335  hypothetical protein  29.91 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00258054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  33.05 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  45.79 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  53.33 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  38.79 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  30.83 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  43.24 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>