152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0179 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  215  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  95.73 
 
 
117 aa  207  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  92.31 
 
 
146 aa  204  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  89.74 
 
 
117 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  88.03 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  88.03 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  88.03 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  88.03 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  88.03 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  88.03 
 
 
117 aa  199  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  88.89 
 
 
117 aa  199  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  56.52 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  51.28 
 
 
117 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  49.09 
 
 
115 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  55.65 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  50 
 
 
113 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  48.72 
 
 
117 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  48.65 
 
 
113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  48.65 
 
 
113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  57.14 
 
 
134 aa  103  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  50.46 
 
 
112 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  50 
 
 
114 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  49.09 
 
 
117 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  55.77 
 
 
113 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  50.89 
 
 
117 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  53.91 
 
 
115 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  45.61 
 
 
113 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  50.45 
 
 
111 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  64.35 
 
 
115 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  49.54 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  54.13 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  53.27 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  42.98 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  51.89 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  53.98 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  53.98 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  52.21 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  52.75 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  49.53 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  56 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  53.26 
 
 
117 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  54.21 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  54.21 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  47.71 
 
 
113 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  43.52 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  46.53 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  44.35 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  57.69 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  46.6 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  43.24 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  57.69 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  55.56 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  47.83 
 
 
116 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  51.76 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  49.07 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  51.79 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  43.69 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  43.09 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  49.55 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  42.34 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  42.72 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  40.83 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  46.84 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  46.15 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  43.93 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  37.9 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  43.4 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  43.64 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  36.73 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  41.94 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  40.22 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  34.69 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  40.59 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  37.39 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  37.98 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  37.82 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  51.85 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  32.2 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  32.74 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>