109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6954 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 126 aa  238  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  60.66 
 
 		 123 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  54.1 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  51.64 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  50.42 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  54.24 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  55.34 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  55.1 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  47.01 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  47.01 
 
 		 195 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  46.79 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  43.33 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  42.06 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0548  hypothetical protein  43.28 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  44.64 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  45.87 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  37.69 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  39.23 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  39.23 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  45 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  41.6 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  37.29 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  35.38 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  44.55 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  44.55 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  42.24 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  43.56 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  42.57 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  44.55 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  42.73 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  38.58 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  52.38 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  36.8 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  49.5 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  36.44 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  38.75 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  31.54 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  38.02 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  38.66 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  32.26 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  34.75 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  36.97 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  38.32 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  41.46 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  36.21 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  31.19 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  38.27 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  33.96 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  37.61 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.19 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  38.71 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  33.96 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05150  predicted membrane protein  40.2 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.946396  normal  0.523625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  39.08 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  31.93 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  38.37 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  45.59 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  39.44 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  37.84 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  35.92 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  37.21 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  34.17 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  42.65 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  35.14 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  35.64 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  35.06 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0671  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.17092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  39.02 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  35.77 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  36.67 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>