124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  100 
 
 
130 aa  244  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  38.69 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  39.2 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  38.76 
 
 
129 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  39.09 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  38.52 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  34.33 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  35.46 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  40.48 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  36.22 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.22 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.22 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  36.94 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  35.38 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  40.32 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  33.08 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  35.61 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  34.4 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  37.21 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05150  predicted membrane protein  41.51 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.946396  normal  0.523625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  35.24 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  38.89 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  37.6 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  30.08 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  39.64 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  30.17 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  33.63 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  33.9 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  30.7 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  35.96 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  37.39 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  38.26 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  35.34 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  35.66 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  33.87 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  37.7 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  43.75 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  31.62 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  34.94 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  41.56 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  30.4 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  32.5 
 
 
117 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  44.93 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  38.96 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  41.57 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  35.37 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  33.06 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  31.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  31.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  31.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  31.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  31.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  39.25 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  30.89 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  45.83 
 
 
113 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  38.67 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  31.67 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  32.23 
 
 
117 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  30.83 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  37.36 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  31.15 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  32.26 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  31.03 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  32.23 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  43.94 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  33.77 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  31.45 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  41.43 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>