111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  100 
 
 
142 aa  272  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  41.35 
 
 
141 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  41.79 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  40.44 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  37.21 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  38.58 
 
 
131 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  39.09 
 
 
130 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  40.65 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  36.22 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  39.06 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  40.65 
 
 
135 aa  84.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
195 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  36.51 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  40.94 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  41.86 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  42.02 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  49.4 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  35.78 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  33.88 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  34.68 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  33.88 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  33.88 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  32.26 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  37.14 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  40.37 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  38.58 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  36.92 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  41.6 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  36.72 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  33.85 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  31.4 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  46.48 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  33.85 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  37.8 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  33.59 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  30.83 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  31.71 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0548  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  33.1 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  28 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  36.13 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  35.54 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  33.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  31.9 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  34.45 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  32.79 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  31.54 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  32.77 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  38.14 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  28.91 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  31.15 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  29.51 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.48 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  32.77 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  33.61 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  35.94 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  29.77 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  37.98 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  33.02 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  39.2 
 
 
119 aa  52  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  35.14 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  33.93 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  32.94 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  36.51 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  30.51 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  30.53 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  43.84 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  36.22 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  33.07 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  46.05 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  30 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  32 
 
 
136 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  34.72 
 
 
116 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  42.03 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  32.03 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  31.43 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  24.55 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  39.71 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  34.48 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>