150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1137 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  100 
 
 
134 aa  258  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  58.02 
 
 
133 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  61.74 
 
 
137 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  59.13 
 
 
115 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  56.25 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  60.94 
 
 
134 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  40.87 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  40.87 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  41.88 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  40.87 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  36.75 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 
111 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  40.37 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  47.31 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  41.88 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  41.75 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  38.68 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  37.07 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  43 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  60.61 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  42.45 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  41.07 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  40.16 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  40.78 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  37.39 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  32.77 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  33.61 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  37.74 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  44.44 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  34.91 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  39.18 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  36.45 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  36.89 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  40 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  37.96 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  40 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  37.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  32.54 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  33.05 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  35 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  35 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  36.7 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  43.69 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  44.66 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  37.93 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  33.86 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  41.44 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  43.69 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  41.86 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  36.21 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  37.93 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  37.93 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  34.51 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  41.75 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  33.96 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  33.94 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  38.26 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  37.19 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  31.54 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  45.83 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  47.71 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  37.17 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  38.79 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  40.24 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  29.32 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  38.18 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  41.74 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>