128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4516 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 135 aa  253  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  48.03 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  38.76 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  42.62 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  47.86 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  38.13 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  51.81 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  45.56 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  38.84 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  42.28 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  40.65 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  41.6 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  37.59 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  43.09 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  41.8 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  38.84 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  40.54 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  40.65 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  40.62 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  48.6 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  40.65 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  39.69 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  38.89 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  39.26 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  37.98 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  44.33 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  41.8 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  37.8 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  41.49 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  39.06 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  35.61 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  38.79 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  41.05 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  39.84 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  37.98 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  40.21 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  44.3 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  43.68 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  37.21 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  52.86 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  38.4 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  37.1 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  40.16 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  37.69 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  52.33 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  34.68 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  34.68 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.38 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  49.25 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  34.4 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  41.38 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  37.19 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  39.83 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  41.98 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  29.84 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  35.05 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  41.56 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  38.27 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  39.32 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  41.25 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  40.26 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  35.38 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  39.02 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  41.13 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  42.25 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  39.13 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  37.93 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  42.68 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  35.51 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  39.06 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  33.88 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  33.93 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  45.21 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  41.25 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  34.07 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  36.21 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  36.21 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  32.79 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  36.21 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>