55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0053 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  227  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  36.67 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  40 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  32.5 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05150  predicted membrane protein  33.61 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.946396  normal  0.523625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  36.59 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  37.96 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  39.02 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  36.14 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  42.11 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  32.5 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 
117 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  38.67 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  32.26 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  34.48 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  43.21 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  38.18 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  40 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  34.43 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  36.44 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  34.43 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  33.94 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  42.11 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  35.8 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  30.33 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  31.68 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  37.07 
 
 
115 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  39.71 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  28.1 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  34.48 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  42.11 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  32.43 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  31.31 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  39.71 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  31.25 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  32.1 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  34.25 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  41.1 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  29.49 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  32.14 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  41.1 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  35 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>