138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2711 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  100 
 
 
145 aa  278  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  39.82 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  43.52 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  40.91 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  39.32 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  43.4 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  38.6 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  41.96 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  39.25 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  34.17 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  30.56 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  39.64 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  40.18 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.92 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  40.4 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  36.11 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  32.52 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  40.57 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  37.14 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  37.14 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  39.22 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  39.62 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  40.74 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  39.17 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  34.23 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  38.33 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  41.94 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  35.85 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  36.89 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  29.55 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  37.8 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  39.34 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  48.48 
 
 
66 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  35.04 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  38.71 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 
117 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  33.63 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  37.25 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  34.92 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.55 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  37.38 
 
 
113 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  38.05 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  37.88 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  34.95 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  31.43 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  30.71 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  37.93 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  32.52 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  30.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  48.39 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  27.19 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  30.77 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  39.76 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  36.79 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  29.13 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  35.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  28.35 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  28.35 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  30.71 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  41.33 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  38.39 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  31.36 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>