135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0596 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  227  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  36.84 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  46.49 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  41.35 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  40.35 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  41.38 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  42.68 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  39.42 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  44.94 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  40.37 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  44.94 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  40.66 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  39.45 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  42.06 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  39.47 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  39.25 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  44.87 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  44.71 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  40.57 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  42.68 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  37.72 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  40.59 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  37.72 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.58 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  40.35 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  35.78 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  42.5 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  44.3 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  43.9 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  39.25 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  46.97 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  43.68 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  36.27 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  38.37 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  38.27 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  33.05 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  42.68 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  37.38 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  35.51 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  40.28 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  34.45 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  34.43 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  40.19 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  35.64 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3707  membrane protein of unknown function  41.23 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  39.53 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  32.79 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  36.73 
 
 
117 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  36.94 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.62 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  38.55 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  36.04 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  33.67 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  46.15 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  38.67 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  35.48 
 
 
115 aa  57.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  48.75 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  43.18 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  35.19 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  32.17 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  31.45 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  36.61 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  32.04 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  31.62 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  36.61 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  36.79 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  43.02 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  43.9 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  43.9 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  30.97 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>