145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0859 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  100 
 
 
115 aa  212  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  76.11 
 
 
117 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  65.49 
 
 
117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  71.05 
 
 
134 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  67.54 
 
 
139 aa  129  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  70.43 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  70.43 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  69.57 
 
 
124 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  50.91 
 
 
117 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  65.59 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  50 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  49.09 
 
 
117 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  49.09 
 
 
117 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  49.09 
 
 
117 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  48.18 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  48.18 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  48.18 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  48.18 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  48.18 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  48.18 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  58.77 
 
 
122 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  52.94 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  56.86 
 
 
113 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  51 
 
 
114 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  47.06 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  46.53 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  50.44 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  41.59 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  41.59 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  46.36 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  47.06 
 
 
117 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  48.62 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  47.96 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  53.64 
 
 
115 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 
133 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  54.55 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  45.1 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  40.87 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  50.43 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  42.16 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  41.51 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  44.9 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  46 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  42.06 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  44.12 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  36.61 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  41.9 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  44.14 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0059  putative transmembrane protein  64.35 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0902612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  55.88 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  55.88 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  46.08 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  46.08 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  46.07 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  41.49 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  43.18 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  39.36 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  40.2 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  42.2 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  45.16 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  34.91 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  35.58 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  38.2 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  39.29 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  44.64 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  39.62 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  47.57 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  35.92 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  32 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  42.39 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  42.11 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  34.86 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  32.76 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  39.64 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3316  membrane protein of unknown function  39 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>