88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1258 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  100 
 
 
121 aa  225  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  54.39 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  54.39 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  53.7 
 
 
113 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4576  membrane protein of unknown function  47.9 
 
 
121 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2616  hypothetical protein  48.74 
 
 
120 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.506732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  42.42 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  40.17 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  40.4 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  39.39 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  38.78 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  38.38 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  36.79 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  36.28 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  36.28 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  37.37 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  37.07 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  40.18 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  35.51 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  35.35 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  35.42 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  35.19 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  36.04 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  37.62 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  39.47 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  35 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  35.35 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  33.66 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  37.86 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  38.78 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  39.56 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  37.65 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  34.34 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  40.54 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  44.87 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  38.78 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  31.25 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  34.51 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  28.83 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  39 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  35.11 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  33.66 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  39 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00781  hypothetical protein  37.65 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  33.93 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  31.18 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  25.89 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  31.82 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  28 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  33.8 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  32.74 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  40.59 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  38.04 
 
 
114 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  36.79 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  29.66 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  38 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  32.32 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  32.32 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  26.36 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>