22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00781 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00781  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  257  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0076  hypothetical protein  68.15 
 
 
136 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.648217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4576  membrane protein of unknown function  32.77 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  38.39 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2616  hypothetical protein  30.65 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.506732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  32.2 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  30.28 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  33.91 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  34.75 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  35.4 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  35.45 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>