141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0493 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 122 aa  228  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  62.93 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  58.77 
 
 		 115 aa  133  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  60.34 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  62.28 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  61.54 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  62.5 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  62.5 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  60 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  63.92 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  49.02 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  44.07 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  51.49 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  62.5 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  49.5 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  47 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  46 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  47.52 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  47 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  50.5 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  48.48 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  45.08 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  44.9 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0059  putative transmembrane protein  70.18 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  49.49 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  44.25 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  44.25 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  39.02 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  44.83 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  39.83 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  48.39 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  58 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  40.37 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  44.12 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  47.52 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  40.17 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  46 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  37.29 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  38.53 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  41.18 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  47.47 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  40.57 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  48.15 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  47.06 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  62.5 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  62.5 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  45.54 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  45.54 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  39.66 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  35.51 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  48.75 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  38.66 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  47.52 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  37.61 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  33.05 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  45 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  40.23 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  36 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  38.16 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  41.79 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  43.28 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  38.37 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  39 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  44 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  45.21 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4576  membrane protein of unknown function  32.23 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  37.23 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  38.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  50.91 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  35.64 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>