115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0368 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  100 
 
 
119 aa  228  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  46.49 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  42.99 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  38.21 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  41.53 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  41.46 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  36.21 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  46.84 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  38.67 
 
 
114 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3707  membrane protein of unknown function  43.33 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  48.1 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  36.9 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  48.61 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  40.45 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  34.34 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  35.23 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  35.96 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  41.56 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  36.21 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  40.58 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  35.96 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  34.13 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  46.58 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  38.96 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  39.13 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  36.47 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  36.67 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  37.65 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  42.03 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  32.43 
 
 
117 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  40.85 
 
 
125 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  35.56 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  43.06 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  36.76 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  33.96 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  40.28 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  36.59 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  36.47 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  34.94 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  34.94 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  41.67 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  42.03 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  34.12 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  37.68 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  35.96 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  39.73 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  35.21 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  41.1 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  30.86 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  35.62 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  34.91 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  34.48 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  36.71 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  40.26 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  34.18 
 
 
117 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  40.74 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  48 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  34.72 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  32.05 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  38.89 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  52.38 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  48.84 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  34.52 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  48.84 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  35.62 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  35 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3316  membrane protein of unknown function  33.8 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  37.21 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  38.2 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0255  hypothetical protein  47.89 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  48.84 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  31.91 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  33.75 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  38.57 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  32.86 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>