106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1697 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  100 
 
 
108 aa  202  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  37.76 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  34.86 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  34.86 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  44.74 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  34.51 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  37.38 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  40.21 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  33.94 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  40.59 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  48.1 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  36.11 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  35.34 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  45.16 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  36 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  35 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  36.27 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  32.67 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  32.41 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  34.65 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  39.19 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  47.69 
 
 
115 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0335  hypothetical protein  42.31 
 
 
123 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00258054  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  43.24 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  30.84 
 
 
195 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  37.38 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  30.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  37.97 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  31.43 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  31.33 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  37.68 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  33.05 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  31.93 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  37.23 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  37.5 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  40.26 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  28.83 
 
 
130 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  39.78 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  34.65 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  33.77 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  29.7 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  33.77 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  30.48 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  31.68 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  28.71 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  32.65 
 
 
117 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  30.58 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  28.71 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32.47 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32.47 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  40.28 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32.47 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32.47 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  35 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  35.96 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32.47 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32.47 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  39.44 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  29.41 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05150  predicted membrane protein  46.07 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.946396  normal  0.523625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  36.84 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  41.51 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  39.73 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  30.86 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  30.39 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  34.18 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  29.9 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  32.67 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  34.25 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  35.8 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  30.77 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  41.43 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  34.74 
 
 
134 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  42.11 
 
 
111 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  32.47 
 
 
126 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  27.03 
 
 
131 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  41.07 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>