98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5883 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 121 aa  230  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  38.78 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  41.84 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  36.73 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  36.08 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  33.67 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  31.73 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  32.65 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  31.96 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  46.15 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  31.96 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  31.96 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  31.96 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  31.96 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  31.96 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  39.32 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  45.83 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  36.47 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  36.47 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  33.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  34.45 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  32.04 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  44 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  33.65 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  30.89 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  28.46 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  30.85 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  34.04 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  34.62 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  30.77 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2961  hypothetical protein  44.58 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  26.27 
 
 		 117 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  39.58 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  31.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  31.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  30.48 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  35.05 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  25.89 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  28.23 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  35.06 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  28.3 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  29.13 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  28.85 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  31.17 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  51.92 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  29.2 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  38.75 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  39.44 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  28.16 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  37.11 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  43.9 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  43.9 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  46.43 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  39.8 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  37.76 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  28.16 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  33.78 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  39.47 
 
 		 130 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  36.08 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  28.71 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  35.94 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  34.55 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  36.08 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  30.95 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  33.78 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  32.94 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  30.99 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  32.65 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>