133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2988 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 119 aa  226  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  82.35 
 
 		 120 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3707  membrane protein of unknown function  49.59 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  41.07 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  46.15 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  41.28 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  45.16 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  52.56 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  45.45 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  42.72 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  42.99 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  40.18 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  41.75 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  48.68 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  40.78 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  46.25 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  39.81 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  46.91 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  42.16 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  46.08 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  51.9 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  44.71 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  38.28 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  42.16 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  38.2 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  41.35 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  43.21 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  42.5 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  38.39 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  48.61 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  34.91 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  43.96 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  37.74 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  34.86 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  44.87 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  49.33 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  39.56 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  44.19 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  42.5 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  46.34 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  37.78 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  37.78 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  36.27 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  46.27 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  37.11 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  55.93 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  35.11 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  38.89 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  37.18 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  36.9 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  38.37 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  40.3 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  28.1 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  41.18 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  29.59 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  37.88 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  28.95 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  31.96 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  35.14 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  44.16 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  31.03 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  31.96 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  48.81 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  47.5 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>