123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0875 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 125 aa  234  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  46.67 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  40.52 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  40.16 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  42.45 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  39.37 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  40.18 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  39.64 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  40.19 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  40.52 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  40.52 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  40.52 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  38.14 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  39.64 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  39.5 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  37.82 
 
 		 112 aa  66.6  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  40.54 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  37.01 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  44.09 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  35.38 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05150  predicted membrane protein  39.02 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.946396  normal  0.523625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  45.24 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  38.32 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  37.29 
 
 		 115 aa  57  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  34.75 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  44.94 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  44.05 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  30.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  30.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  30.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  30.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  32.73 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  30.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  30.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  36.75 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  31.93 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  32.73 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  33.63 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  41.1 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  37.38 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  29.46 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  30.91 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1697  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0340631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  38.67 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  29.75 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  35.96 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  29.91 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  34.51 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  36.89 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  32.32 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  36.94 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  30.53 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  36.13 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  29.27 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  31.15 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  34.57 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  35.78 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  36.99 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  38.66 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  36.99 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  31.71 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  35.19 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  35.19 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  42.65 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  41.43 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  29.09 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  31.58 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>