122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2284 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  100 
 
 		 117 aa  228  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  36.61 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  44.71 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  38.05 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  39.62 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  34.69 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  35.78 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  34.95 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  37.89 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  37.23 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  32.65 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  31.68 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  34.07 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  40.23 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  38.82 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  38.46 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  31.63 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  37.36 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  39.74 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  38.82 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  32.65 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  40.26 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  38.37 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  38.37 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  34.38 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  38.37 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  38.98 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  37.66 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  38.98 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  38.82 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0335  hypothetical protein  37.08 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00258054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  38.98 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  44.87 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  32.29 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  47.46 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  37.18 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  44.12 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  42.35 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  31.82 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  37.97 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  38.24 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  36.46 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  40.21 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  34.95 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  33.96 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  36.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  38.67 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  34.18 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  31.15 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  45.21 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  31.87 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  39.44 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  40.79 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  47.06 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  31.43 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  37.68 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  31.65 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  44.19 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  35.62 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2421  membrane protein  41.51 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000745909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  32.22 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  35.62 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>