63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2421 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2421  membrane protein  100 
 
 		 73 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000745909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  46.03 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  39.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  36.92 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  41.51 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0335  hypothetical protein  45.1 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00258054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  38.24 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  36.76 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  36.11 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  37.7 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  38.24 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  38.24 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  31.34 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  34.29 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  37.7 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3707  membrane protein of unknown function  58.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  34.43 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  33.82 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  33.82 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6256  membrane protein of unknown function  37.29 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  38.18 
 
 		 117 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  38.18 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  33.82 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  34.78 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  38.18 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  37.68 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  39.13 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32.35 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  31.88 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  33.8 
 
 		 113 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>