101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6256 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6256  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 125 aa  236  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  39.29 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  39 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  31.78 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  29.63 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  35.85 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  41.12 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  30 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  30.09 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  37.86 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  37.04 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  34.04 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  31.18 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  29.41 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  30.56 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  31.9 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  29.36 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  29.36 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  29.36 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  29.36 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  29.36 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  29.36 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  37.35 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  27.03 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  34.29 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  34.86 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0875  membrane protein of unknown function  32.32 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  0.295659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5883  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  35.4 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2421  membrane protein  39.39 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000745909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  31.78 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4957  membrane protein of unknown function  31.25 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  31.07 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  42.03 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5268  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5013  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4842  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4857  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5393  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  30.86 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  29.91 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5325  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5283  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.309234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5674  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5249  hypothetical protein  30.12 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  33.7 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  37.38 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  34.38 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  31 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  33.63 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  34.57 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  39.18 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  31.37 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  35.19 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  31.53 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  36.13 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  40.62 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  31.58 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  38.27 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  28.83 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  30.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  30.83 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  30 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2961  hypothetical protein  39.18 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  32.95 
 
 		 115 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  27.96 
 
 		 119 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 119 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  32.08 
 
 		 126 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  29.9 
 
 		 116 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  34.62 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  27.93 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  34.21 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  36.05 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  32.71 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  29.51 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  32.29 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  28.57 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  32.29 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  29.27 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  29.27 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>