57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4576 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4576  membrane protein of unknown function  100 
 
 
121 aa  229  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2616  hypothetical protein  75.42 
 
 
120 aa  180  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.506732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  43.36 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  43.36 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  47.06 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  42.74 
 
 
113 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.9 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  33.04 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  32.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  36.7 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  32.17 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  33.91 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0076  hypothetical protein  36.97 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.648217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  31.3 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  31.3 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  31.3 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  31.3 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  31.3 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  31.3 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  34.23 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  35.96 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  30.7 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  33.91 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  31.78 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  35.14 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  32.08 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  32.11 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  30.63 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  37.17 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  31.36 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  35.48 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  34.51 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  30.28 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  30.84 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  31.73 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  29.41 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  29.41 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00781  hypothetical protein  36.73 
 
 
139 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  26.79 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  34.29 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  31.97 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  30.36 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  34.51 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  33.64 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  28.57 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  28.81 
 
 
145 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>