90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0645 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 135 aa  260  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  70.4 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  58.68 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  56.2 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  50.79 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  50 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  52.85 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  52.1 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  49.61 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  56.56 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  41.73 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  41.6 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  47.15 
 
 		 195 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  40.62 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  42.37 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  39.23 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  41.27 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  40.68 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0548  hypothetical protein  38.06 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  45.19 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  40.32 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  39.5 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  39.5 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  42.31 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  42.61 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  43.53 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  40.32 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  35.34 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  35.77 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  33.87 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  36.75 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  39.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  30.91 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  37.39 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  33.6 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  36.36 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  33.6 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  33.6 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  33.6 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  33.6 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  33.6 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  37.17 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  36.97 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  39.67 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  35.45 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  35.04 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  31.09 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  34.68 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  36.75 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  29.06 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  34.17 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  32.2 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  30.77 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  32.77 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  34.75 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  31.15 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  31.09 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  34.55 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  32.11 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  41.33 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  28.45 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  39.6 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  35.53 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  29.91 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  32.61 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05150  predicted membrane protein  40.85 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.946396  normal  0.523625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  39.73 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  30.4 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  39.13 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  38.75 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  27.52 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  31.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  35.24 
 
 		 134 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  39.71 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  29.91 
 
 		 111 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>