69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0548 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0548  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  262  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  44.12 
 
 
129 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  43.28 
 
 
126 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  46.15 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  39.69 
 
 
123 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  38.64 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  37.59 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  38.1 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  43.08 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  34.31 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  36.43 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  36.96 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  38.06 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  36.43 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  33.59 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.43 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.43 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  32.31 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  36.23 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  42.39 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  32.81 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  33.08 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  38.04 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  33.33 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  45.56 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  34.06 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  36.43 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  33.83 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  32.28 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  30.58 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  37.76 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  27.97 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  36.43 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  37.01 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  34.68 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  32.52 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  45.26 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  37.7 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  28.46 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  31.82 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  44.44 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  30.3 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  30.3 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  30.3 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  30.3 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  31.06 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  30.3 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  30.3 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  32.28 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  31.82 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  30.65 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  40.74 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  31.45 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  29.55 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  31.5 
 
 
113 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  41.94 
 
 
145 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  31.5 
 
 
113 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  32.23 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  23.39 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  33.93 
 
 
134 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>