264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2753 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2753  rhodanese-like protein  100 
 
 		 140 aa  289  9e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 352 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  32.52 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.29 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40.28 
 
 		 820 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  27.82 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 220 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 480 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  28 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  24.53 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  28.23 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  35.94 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  27.36 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  24.53 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.72 
 
 		 550 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.29 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  34.52 
 
 		 393 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  30.59 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.71 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 489 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 		 392 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  29.81 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  35.87 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 370 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 233 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.51 
 
 		 247 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  27.45 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.47 
 
 		 560 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.68 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 472 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  28.8 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  35.94 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.97 
 
 		 346 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  37.31 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.43 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  28.8 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 470 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 386 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  29.09 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.09 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  26.04 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  26.72 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  30.49 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.9 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.15 
 
 		 390 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 376 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  26.44 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.8 
 
 		 464 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>