More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1408 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1408  transposase IS605 OrfB  100 
 
 		 426 aa  875    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.689259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2430  transposase IS605 OrfB  61.23 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0218  transposase IS605 OrfB  46.21 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1689  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  44.95 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  38.55 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  37.35 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  37.35 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2486  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  30.23 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  26.81 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  34.88 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  36.25 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  38 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  38 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  25.93 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  40.13 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  40.13 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  40.13 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  40.13 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  40.13 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  38 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  24.61 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  31.22 
 
 		 223 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  34.25 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  27.2 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  25.23 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  32.56 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  39.04 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  32.74 
 
 		 394 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  31.21 
 
 		 370 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  26.91 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  35.91 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  34.65 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  27.52 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  37.67 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  26.47 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0746  ISCpe4, transposase  33.99 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  26.25 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  35.8 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  27.51 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  35.98 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  35.98 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  34.64 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  35.98 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  35.98 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.34 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  34.04 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  28.61 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0628  transposase, IS605 OrfB family  37.37 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  27.78 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  34.27 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0022  IS891/IS1136/IS1341 transposase  26.6 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  31.14 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  27.38 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  23.69 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2849  transposase, IS605 OrfB family  38.92 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  23.69 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  31.93 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  33.01 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  23.69 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  27.11 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  27.27 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  25.71 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  28.62 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  27.61 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  33.71 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  24.43 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.51 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  30.99 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  35.88 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  30.2 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  27.11 
 
 		 383 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.53 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  32.3 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  28.08 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  33.52 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.73 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  36.14 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  27.88 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  32.88 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  32.74 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  34.18 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  25.45 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  35.37 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  33.15 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  29.11 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  31.41 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3231  putative transposase IS605 family  35.37 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0822  putative transposase IS605 family  35.37 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0682059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  31.88 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  34.73 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  34.52 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  26.76 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  35.37 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  30.41 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>