More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4291 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4291  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1809  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3918  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.78 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.33 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 248 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.3 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  40.44 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.41 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.89 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  40.89 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 241 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  43.95 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.81 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.67 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  39.38 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  40.62 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  41.26 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  41.07 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  41.96 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>