286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3741 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  98.86 
 
 
486 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  98.48 
 
 
486 aa  544  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  98.86 
 
 
486 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  98.48 
 
 
486 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  98.86 
 
 
486 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  97.72 
 
 
486 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  98.1 
 
 
486 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  97.72 
 
 
486 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  78.03 
 
 
490 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  77.65 
 
 
490 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  77.27 
 
 
490 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  76.89 
 
 
490 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  76.89 
 
 
490 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  66.29 
 
 
487 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.39 
 
 
497 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  60.61 
 
 
495 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  63.26 
 
 
498 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  62.98 
 
 
487 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  60.98 
 
 
495 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  62.21 
 
 
486 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  65.27 
 
 
493 aa  334  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  61.83 
 
 
486 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  61.83 
 
 
486 aa  331  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  62.88 
 
 
452 aa  331  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  63.74 
 
 
488 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  61.45 
 
 
486 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  63.36 
 
 
488 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.88 
 
 
490 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  63.36 
 
 
488 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  62.88 
 
 
490 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  61.45 
 
 
486 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  61.45 
 
 
486 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.45 
 
 
486 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  61.45 
 
 
486 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  61.45 
 
 
486 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  63.36 
 
 
488 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  60.38 
 
 
488 aa  328  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  62.98 
 
 
488 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.85 
 
 
490 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  58.85 
 
 
488 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  58.85 
 
 
488 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.69 
 
 
488 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  59.85 
 
 
490 aa  311  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  58.46 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.46 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.46 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  58.46 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  58.46 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  58.85 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.94 
 
 
488 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.36 
 
 
490 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.23 
 
 
493 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  52.27 
 
 
485 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  53.7 
 
 
486 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  46.88 
 
 
492 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  49.43 
 
 
489 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  49.24 
 
 
490 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  49.24 
 
 
490 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  49.24 
 
 
490 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  50.57 
 
 
459 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.86 
 
 
490 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  48.46 
 
 
464 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  48.46 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  49.04 
 
 
497 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  48.13 
 
 
510 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  47.92 
 
 
490 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  47.91 
 
 
493 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  46.42 
 
 
496 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.4 
 
 
497 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.66 
 
 
478 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.48 
 
 
490 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  44.75 
 
 
451 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  48.54 
 
 
484 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.28 
 
 
493 aa  208  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  45.77 
 
 
471 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.65 
 
 
505 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.07 
 
 
505 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  48.52 
 
 
485 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  42.15 
 
 
548 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.53 
 
 
492 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
489 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
498 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  40.47 
 
 
497 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
489 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
489 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
489 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
489 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
489 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.85 
 
 
491 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.17 
 
 
494 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  38.85 
 
 
491 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  40.68 
 
 
472 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.68 
 
 
472 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  47.29 
 
 
491 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  39.54 
 
 
497 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  39.54 
 
 
497 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  40.61 
 
 
520 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.22 
 
 
499 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.92 
 
 
472 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>