More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3048 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3048  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5119  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3004  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.91 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2006  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.25 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50600  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.857605  normal  0.0631781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3137  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00811136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1746  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2451  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1774  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.793189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2763  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0559  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2822  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2878  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2830  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.07 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4348  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>